MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori B8 plasmid HPB8p

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014257	GC	4	8	178	185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014257	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014257	GTT	2	6	213	218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014257	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014257	AAC	2	6	234	239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014257	T	6	6	283	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014257	TTGC	2	8	324	331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014257	CGCTT	2	10	397	406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014257	CGCT	2	8	463	470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014257	T	7	7	576	582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014257	GTT	2	6	595	600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014257	T	6	6	605	610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014257	CAAC	2	8	640	647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014257	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014257	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014257	A	6	6	686	691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014257	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014257	A	6	6	742	747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014257	T	6	6	754	759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014257	ACTAG	2	10	800	809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014257	A	7	7	823	829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014257	CAAA	2	8	904	911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014257	T	8	8	947	954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014257	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014257	AAC	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
26	NC_014257	ACCTA	2	10	1034	1043	40 %	20 %	0 %	40 %	298717636
27	NC_014257	TA	3	6	1070	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	298717636
28	NC_014257	CAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
29	NC_014257	TGT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717636
30	NC_014257	TCA	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717636
31	NC_014257	AT	3	6	1279	1284	50 %	50 %	0 %	0 %	298717637
32	NC_014257	CT	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	298717637
33	NC_014257	CT	3	6	1346	1351	0 %	50 %	0 %	50 %	298717637
34	NC_014257	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	298717637
35	NC_014257	TCTT	2	8	1400	1407	0 %	75 %	0 %	25 %	298717637
36	NC_014257	ACTTT	2	10	1460	1469	20 %	60 %	0 %	20 %	298717637
37	NC_014257	T	6	6	1535	1540	0 %	100 %	0 %	0 %	298717637
38	NC_014257	CTTAA	2	10	1554	1563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014257	ATA	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014257	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014257	ACC	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014257	CAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014257	A	7	7	1823	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	298717638
44	NC_014257	CAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
45	NC_014257	A	6	6	1897	1902	100 %	0 %	0 %	0 %	298717638
46	NC_014257	TAA	2	6	1917	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
47	NC_014257	AAATC	2	10	1962	1971	60 %	20 %	0 %	20 %	298717638
48	NC_014257	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
49	NC_014257	AAC	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
50	NC_014257	CAAT	2	8	2040	2047	50 %	25 %	0 %	25 %	298717638
51	NC_014257	CTAA	2	8	2189	2196	50 %	25 %	0 %	25 %	298717639
52	NC_014257	CT	4	8	2207	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	298717639
53	NC_014257	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
54	NC_014257	CA	3	6	2320	2325	50 %	0 %	0 %	50 %	298717639
55	NC_014257	ACA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
56	NC_014257	AC	3	6	2362	2367	50 %	0 %	0 %	50 %	298717639
57	NC_014257	AG	3	6	2416	2421	50 %	0 %	50 %	0 %	298717639
58	NC_014257	ACA	2	6	2533	2538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
59	NC_014257	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
60	NC_014257	ACA	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
61	NC_014257	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
62	NC_014257	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
63	NC_014257	CAAGG	2	10	2702	2711	40 %	0 %	40 %	20 %	298717639
64	NC_014257	CAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
65	NC_014257	AAT	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
66	NC_014257	ATG	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
67	NC_014257	AACAC	2	10	2882	2891	60 %	0 %	0 %	40 %	298717639
68	NC_014257	TC	3	6	2906	2911	0 %	50 %	0 %	50 %	298717639
69	NC_014257	AAC	3	9	2934	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
70	NC_014257	ACAA	2	8	2961	2968	75 %	0 %	0 %	25 %	298717639
71	NC_014257	CTA	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
72	NC_014257	AG	3	6	3011	3016	50 %	0 %	50 %	0 %	298717639
73	NC_014257	CAA	2	6	3050	3055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
74	NC_014257	ACA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
75	NC_014257	TCA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
76	NC_014257	TCA	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
77	NC_014257	TCA	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
78	NC_014257	CAAGGA	2	12	3218	3229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298717639
79	NC_014257	AGAA	2	8	3244	3251	75 %	0 %	25 %	0 %	298717639
80	NC_014257	AAC	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
81	NC_014257	GAAC	2	8	3350	3357	50 %	0 %	25 %	25 %	298717639
82	NC_014257	GAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	298717639
83	NC_014257	GCAA	2	8	3428	3435	50 %	0 %	25 %	25 %	298717639
84	NC_014257	CAG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717639
85	NC_014257	CTTGAA	2	12	3554	3565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298717639
86	NC_014257	AG	3	6	3566	3571	50 %	0 %	50 %	0 %	298717639
87	NC_014257	AC	3	6	3598	3603	50 %	0 %	0 %	50 %	298717639
88	NC_014257	AGAA	2	8	3676	3683	75 %	0 %	25 %	0 %	298717639
89	NC_014257	ATT	2	6	3697	3702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
90	NC_014257	TCAAA	2	10	3749	3758	60 %	20 %	0 %	20 %	298717639
91	NC_014257	CAAG	2	8	3827	3834	50 %	0 %	25 %	25 %	298717639
92	NC_014257	ACA	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
93	NC_014257	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717639
94	NC_014257	AGA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717639
95	NC_014257	AG	3	6	3983	3988	50 %	0 %	50 %	0 %	298717639
96	NC_014257	ACA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
97	NC_014257	A	6	6	4038	4043	100 %	0 %	0 %	0 %	298717639
98	NC_014257	GA	3	6	4052	4057	50 %	0 %	50 %	0 %	298717639
99	NC_014257	A	6	6	4090	4095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014257	T	7	7	4099	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	298717640
101	NC_014257	TTC	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
102	NC_014257	TTG	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640
103	NC_014257	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717640
104	NC_014257	TCT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
105	NC_014257	T	7	7	4395	4401	0 %	100 %	0 %	0 %	298717640
106	NC_014257	AGT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717640
107	NC_014257	T	6	6	4480	4485	0 %	100 %	0 %	0 %	298717640
108	NC_014257	GTG	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
109	NC_014257	TTCAA	2	10	4591	4600	40 %	40 %	0 %	20 %	298717640
110	NC_014257	TTGTTT	2	12	4704	4715	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298717640
111	NC_014257	TTCT	2	8	4791	4798	0 %	75 %	0 %	25 %	298717640
112	NC_014257	TGTCA	2	10	4875	4884	20 %	40 %	20 %	20 %	298717640
113	NC_014257	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717640
114	NC_014257	TTCAA	2	10	5119	5128	40 %	40 %	0 %	20 %	298717640
115	NC_014257	TAA	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717640
116	NC_014257	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717640
117	NC_014257	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
118	NC_014257	GTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
119	NC_014257	T	6	6	5529	5534	0 %	100 %	0 %	0 %	298717640
120	NC_014257	TTATT	2	10	5576	5585	20 %	80 %	0 %	0 %	298717640
121	NC_014257	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640
122	NC_014257	TAA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014257	CCT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014257	CT	3	6	5891	5896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014257	TCC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014257	CAA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014257	TTA	2	6	5991	5996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.